Materia principal

Proporcionar al alumno las bases teóricas y prácticas esenciales para el uso de la Genómica y la Proteómica en el área de Biotecnología.

Biotecnólogo

CONTENIDOS TEÓRICOS:

Genómica:

Genómica:

1. Estructura de los genomas.

2. Secuenciación de genomas.

3. Análisis de secuencias genómicas.

4. Pangenómica y metagenómica.

5. Bases de datos genómicos

5. Transcriptómica

Proteómica:

Los principales bloques temáticos son:

1.   Introducción a la Biología de sistemas y la Proteómica.

2.   Tratamiento de las muestras para los estudios proteómicos.

3.   Electroforesis bidimensional en gel.

4.   Separaciones multidimensionales.

5.   Espectrometría de masas.

6.   Bases de datos en los estudios proteómicos.

7.   Proteómica cuantitativa.

8.   Arrays proteicos.

9.   Proteómica y Biotecnología.

10. Proteómica y Biomedicina. Búsqueda de biomarcadores.

Genómica:

(En el aula de informática o formando parte de seminarios):

Análisis de secuencias génicas

Genomas

Metagenomas y Pangenomas

Proteómica:

Preparación, cuantificación y visualización de muestras proteicas.

Programas informáticos de análisis proteómico.

Identificación de microorganismos mediante MALDI-TOF.

SEMINARIOS

Espectrometría de masas MALDI-TOF para la identificación de microorganismos.

MALDI-Imaging.

Presentaciones  de  los  trabajos  realizados  por  los  alumnos  sobre  publicaciones  recientes  de proteómica.

Competencias básicas:

CB2. Que los estudiantes sepan aplicar sus conocimientos a su trabajo o vocación de una forma profesional y posean las competencias que suelen demostrarse por medio de la elaboración y defensa de argumentos y resolución de problemas dentro de la Genómica y Proteómica.

CB3. Que los estudiantes tengan la capacidad de reunir e interpretar datos relevantes para emitir juicios que incluyan una reflexión sobre temas relevantes.

CB4. Que los estudiantes puedan transmitir información, ideas, problemas y soluciones a un público tanto especializado como no especializado.

CB5. Que los estudiantes hayan desarrollado aquellas habilidades de aprendizaje necesarias para emprender estudios posteriores con un alto grado de autonomía.

CE1: Trabajar correctamente en un laboratorio de Genómica y Proteómica utilizando las metodologías más adecuadas para la manipulación de reactivos y aparataje, material biológico, el registro anotado de actividades, la seguridad y la eliminación de residuos.

CE2: Usar las principales bases de datos bibliográficos y biológicos (genómicos, transcriptómicos, proteómicos y metabolómicos) y aplicar las herramientas bioinformáticas básicas.

CE3: Diseñar, realizar y analizar experimentos en Genómica y Proteómica, con un enfoque biotecnológico, aplicando el método científico para la resolución de problemas, y abordándolos de forma integrada y desde diferentes perspectivas.

CE5: Comunicar de manera efectiva, tanto de forma oral como escrita, contenidos científico-técnicos sobre biotecnología (conceptos, ideas, problemas, riesgos, soluciones) utilizando diferentes tecnologías de la información y comunicación, y adaptándose a la situación/contexto y la audiencia.

• Introduction to Genomics, 3º ed. Arthur M. Lesk. Oxford University Press 2017.
• Genomes 4 ed. T.A. Brown. Garland Science. Taylor & Francis group 2018
• Principles of proteomics, 2º ed. Richard M Twyman. Garland science, 2014.
• Introducing proteomics: From concepts to simple preparation, mass spectrometry and data analysis. Josip Lovric, Wiley-Blackwell, 2011.
• Introduction to Proteomics: Principles and applications. Nawin C. Misra, W iley, 2010.

• http://www.hupo.org/
• http://www.eupa.org/
• http://www2.cbm.uam.es/seprot/
• http://www.genebio.com/

Para la evaluación global de la asignatura se considerarán las distintas actividades, según la siguiente tabla:

1. La realización de las prácticas es condición necesaria para superar la asignatura. Las clases prácticas de laboratorio se evaluarán de forma continua controlando el desarrollo de las mismas, así como del análisis de resultados. En el examen escrito se incluirán cuestiones relativas a las prácticas.

2. Se evaluarán las actividades realizadas en los seminarios.

3. Cuestionarios online periódicos para el seguimiento del aprendizaje teórico y práctico.

4. Se realizará una prueba escrita al final del semestre para evaluar la asimilación de conocimientos teóricos. Para superar la asignatura, será necesario superar el 50% de esta prueba.

- Asistir regularmente a las clases teóricas.

- Asistir obligatoriamente a los seminarios y realizar todos los ejercicios y trabajos propuestos.

- Asistir obligatoriamente a las clases prácticas de manera activa.

En caso de no haber superado la convocatoria ordinaria, sólo se conservará la nota de las prácticas y de los seminarios, debiéndose repetir en la convocatoria extraordinaria la prueba escrita objetiva hasta superar la asignatura. La realización de las prácticas es condición necesaria para superar la asignatura.