Microbiología

En esta asignatura se pretende dar a conocer los aspectos más importantes de la diversidad microbiana y de la evolución. Incluye el estudio de su distribución en la naturaleza, las relaciones entre ellos y con el resto de los seres vivos, sus efectos beneficiosos y perjudiciales sobre los seres humanos y los cambios físicos y químicos que realizan en el ambiente. Se resalta su importancia en los diferentes aspectos alimentarios, sanitarios, industriales y medioambientales.

Las materias impartidas en esta asignatura tienen interés en las siguientes orientaciones profesionales: Biólogo/a (BIR, análisis clínicos, ambientales y alimentarios, Biotecnología), Investigación, Docencia.

La asignatura se divide en los siguientes bloques temáticos y temas:

Bloque I. Virología

Se dará una visión general de la estructura, función y actividades biológicas de los virus.

Tema 0. Introducción. ¿Qué es un virus?

Tema 1. Estructura viral

Tema 2. Genética viral

Tema 3. Multiplicación viral

Tema 4. Diversidad de virus y partículas subvíricas. Clasificación.

Tema 5. Evolución de los virus. Origen, relevancia biológica, aplicaciones.

Bloque II. Diversidad Genética Microbiana

Tema 6. Fuentes de la diversidad genética microbiana. Mutación y Recombinación. HGT.

Tema 7. Relevancia biológica de la diversidad genética microbiana.

Tema 8. Genómica microbiana básica

Bloque III. Diversidad y Ecología Microbianas

Tema 9. Taxonomía microbiana y evolución. Principios generales. Criterios de clasificación: pruebas bioquímicas, genéticas y moleculares. Organización taxonómica.

Tema 10. Clasificación de los microorganismos. Historia. El Manual de Bergey. Filogenia microbiana. Colecciones de referencia.

Tema 11. Arqueas

Tema 12. Espiroquetas y Espirilos

Tema 13. Bacterias aeróbicas Gram-

Tema 14. Bacterias anaeróbicas facultativas Gram-

Tema 15. Bacterias anaeróbicas Gram-

Tema 16. Rickettsias. Clamidias

Tema 17. Micoplasmas

Tema 18. Bacterias Quimiolitotróficas

Tema 19. Bacterias Fototróficas

Tema 20. Bacterias Gram+ I: bajo G/C

Tema 21. Bacterias Gram+ II: alto G/C

Tema 22. Bacterias con patrón de división polarizado. Bacterias con vaina. Bacterias deslizantes

Tema 23. Ecología microbiana. Ciclos Biogeoquímicos de los elementos

Tema 24. Microorganismos eucariotas

Programa Clases Prácticas (orientativo)

Análisis microbiológico de aguas

Identificación de microorganismos

Infección con bacteriófagos

Microbiotas

Programa de Actividades de Seminario (orientativo)

AS01- Recursos USAL: Bibliografía

AS02- Columna Winogradsky-I (Introducción y montaje)

AS03- Construcción Cápsidas Víricas Chimera

AS04- ORF Finder

AS05- SARS-CoV-2: detección, variantes, vacunas

AS06- Patogénesis microbiana

AS07- CRISPR-Cas

AS08- Microculturómica

AS09- Microbioma Intestinal Humano

AS10- Cianobacterias

AS11- Restauración de Microbiotas I

AS12- Restauración de Microbiotas II

AS13- Columna Winogradsky-II (Análisis de resultados).

Los listados de Prácticas y Actividades de Seminario son orientativos y pueden modificarse. Las actividades 01, 02, 03, 04 y 06 serán desarrolladas por los estudiantes siguiendo las instrucciones del profesor. Las otras actividades consisten en la exposición por el profesor y debate con los estudiantes de temas de gran actualidad relacionados con la Microbiología. Tanto las Prácticas como las Actividades de Seminario pueden modificarse en contenidos y estructura y sustituirse por otras que se considerasen adecuadas.

Dominar el conocimiento de los diferentes niveles de organización de la materia viva, su origen y los mecanismos evolutivos.

El alumno conocerá:

  1. Concepto y origen de la vida

  2. Tipos y niveles de organización de la vida

  3. Bases genéticas de la biodiversidad

  4. Diversidad de microorganismos

  5. Sistemática y filogenia

  6. Estructura, función e interacción entre biomoléculas

  7. Replicación, transcripción, traducción y modificación del material genético

  8. Metabolismo

  9. Estructura y función de los virus, células procarióticas y eucarióticas

10. Regulación de la actividad microbiana

11. Interacciones entre especies

12. Flujos de energía y ciclos biogeoquímicos en los ecosistemas

Permitir al egresado el ejercicio de actividades de estudio, identificación, análisis y clasificación de los organismos vivos y de los agentes materiales biológicos, así como sus restos y señales de actividad.

- Madigan, M.T., Martinko, J.M., Bender, K.S., Buckley, D.H. y Sathl, D.A. (2015) Brock. Biología de los microorganismos. 14ª Ed. Pearson Education, S.A. (RECOMENDADO)

- Willey, J.M., Sherwood, L.M. y Woolverton, C.J. (2016) Microbiology de Prescott, Harley y Klein. 10 Ed. McGraw-Hill-College.

- Tortora, G.J., Funke, B.R. y Case, C.L. (2015) Microbiology. An introduction. 12th Ed. The Benjamin/Cummings Publishing Company. Addison Wesley Longman, Inc. San Francisco

- Durante el transcurso de la asignatura se emplearán los diversos recursos didácticos, de interacción y de comunicación asociados a las cuentas proporcionadas oficialmente por la Universidad de Salamanca: email, almacenamiento y ofimática, mensajería (Espacio de Chat), videoconferencia (Meet y Zoom), blogs (Diarium) u otros disponibles.

- Manuales y revistas digitales de libre acceso o contratados por la USAL.

- Recursos impresos y digitales de la Biblioteca de Biología y la Biblioteca USAL.

- El acceso a los recursos de todo tipo se canalizará a través del espacio en Studium 108220 Diversidad Microbiana 2223 y las granjas de sitios web Symbaloo Recursos DM y Wakelet de Diversidad Microbiana, específicos para la asignatura.

La comprobación de la adquisición de competencias y el cumplimiento de objetivos se valorará teniendo en cuenta el sumatorio del conjunto de factores que se detallan:

1. Prueba escrita objetiva
2. Evaluación continua sobre el desarrollo de las prácticas
3. Actividades digitales tuteladas sobre recursos microbiológicos online.
4. Participación en clase y asistencia

1. Adquisición de conocimientos teóricos sobre la diversidad microbiana
2. Adquisición de conocimientos y habilidades prácticas sobre procesos modelo.
3. Adquisición de conocimientos sobre recursos digitales y bases de datos de utilidad en Microbiología y Virología
4. Valoración de su asistencia y participación a lo largo del curso

Evaluación continua de las actividades:

• Consultas bibliográficas
• Ejercicios y trabajos de seminario prácticos (húmedos o  informáticos).
• Prácticas de laboratorio
• Tutorías

Prueba escrita sobre el dominio de las competencias que consistirá en un test de respuesta única y preguntas cortas de razonamiento sobre los contenidos teóricos y prácticos desarrollados durante el curso.

La evaluación de las Actividades de Seminario contribuirá en un 30% (10% fichas entregables + 20% seminarios) y las Prácticas en un 10% a la calificación final. La prueba escrita sobre Teoría en un 60%. Será necesario alcanzar la puntuación mínima (50%) requerida en cada una de las partes para poder superar la asignatura.

Es muy aconsejable el repaso semanal tanto de los temas teóricos como de las diferentes actividades planteadas y la consulta temprana a los profesores de todas las dudas que surjan.

El alumnado podrá comprobar periódicamente el nivel de comprensión de los bloques temáticos mediante ejercicios de autoevaluación y la realización de alguna prueba parcial voluntaria, que podrá ser eliminatoria si se demuestra la adquisición de las competencias propuestas.

Solo se conservarán las notas de prácticas y una evaluación continua positiva, debiéndose repetir la prueba objetiva correspondiente a los contenidos teóricos hasta superar la asignatura.