BIOINFORMÁTICA
DOBLE GRADO EN BIOTECNOLOGÍA Y EN FARMACIA
Curso 2024/2025
1. Datos de la asignatura
(Fecha última modificación: 07-06-24 14:01)- Código
- 109527
- Plan
- 2020
- ECTS
- 6
- Carácter
- Curso
- 5
- Periodicidad
- Segundo Semestre
- Idioma
- ESPAÑOL
- Área
- LENGUAJES Y SISTEMAS INFORMÁTICOS
- Departamento
- Informática y Automática
- Plataforma Virtual
Datos del profesorado
- Coordinador/Coordinadora
- Luis Antonio Miguel Quintales
- Grupo/s
- 1
- Centro
- Fac. Biología
- Departamento
- Informática y Automática
- Área
- Lenguajes y Sistemas Informáticos
- Despacho
- D4103 - Facultad de Ciencias
- Horario de tutorías
- Lunes y martes de 15:30 a 18:30
- URL Web
- https://produccioncientifica.usal.es/investigadores/56621/detalle
- lamq@usal.es
- Teléfono
- 6557
2. Recomendaciones previas
Reunir las competencias de las asignaturas siguientes: Informática, Probabilidad y Bioestadística, Genética y Genética Molecular.
3. Objetivos
Conocer el inmenso volumen de información biológica que se encuentra disponible en distintas bases de datos, así como tener las destrezas necesarias para poder consultar y acceder esta información, interrelacionando y sabiendo elegir las fuentes adecuadas para cada circunstancia.
Conocer las distintas aplicaciones de la bioinformática a la biología molecular, medicina, biotecnología y otras disciplinas.
Conocer las principales técnicas y herramientas bioinformáticas que se utilizan hoy en día, comprendiendo los fundamentos algorítmicos en que se basan, así como tener las destrezas para utilizarlas y aplicarlas adecuadamente al análisis de datos biológicos.
4. Competencias a adquirir | Resultados de Aprendizaje
Básicas / Generales | Conocimientos.
Usar las principales bases de datos (biológicos y bibliográficos) de interés en Biotecnología. Saber utilizar las herramientas bioinformáticas más habituales.
Específicas | Habilidades.
Capacidad para buscar, interpretar y analizar bioinformáticamente datos obtenidos de la experimentación en distintas ramas de la Biología, Genómica y Biotecnología en general.
Transversales | Competencias.
- Capacidad de organización y planificación.
- Conocimientos de informática relativos al ámbito de estudio.
- Capacidad de gestión de la información.
- Resolución de problemas.
- Aprendizaje autónomo.
- Adaptación a nuevas situaciones.
5. Contenidos
Teoría.
Parte I. Análisis de secuencias biológicas de DNA, RNA y proteínas
1. Alineamiento de pares de secuencias
2. BLAST y otras búsquedas avanzadas
3. Alineamientos de múltiples secuencias
4. Inferencia filogenética
Parte II. Análisis de genoma completo
5. Análisis de datos de secuenciación masiva
6. Genotipado y análisis de variantes
7. Estudios de asociación de genoma completo (GWAS) y puntuaciones de riesgo poligénico
8. Análisis de expresión diferencial con RNA-seq
9. Ontologías de genes y análisis funcional
6. Metodologías Docentes
Clase magistral: Presentación de los contenidos teóricos del programa mediante la exposición oral, utilizando como apoyo presentaciones con ordenador. Todo el material presentado estará disponible con antelación en la plataforma online.
Seminarios y clases prácticas: Propuesta, resolución y discusión de ejercicios prácticos, en que se expondrá el funcionamiento básico de distintas técnicas/herramientas bioinformáticas que posteriormente deben utilizarse para la resolución de los ejercicios obligatorios propuestos.
Trabajo autónomo del alumno para estudiar, buscar bibliografía y preparar los ejercicios prácticos que se planteen.
El alumno dispondrá en todo momento de la ayuda de la plataforma online en que podrá encontrar todo el material de la asignatura, así como las referencias bibliográficas o de otro tipo que puedan ayudar al estudio de la asignatura.
Tutorías personalizadas para la resolución de dudas.
7. Distribución de las Metodologías Docentes
8. Recursos
Libros de consulta para el alumno.
Bioinformatics and Functional Genomics, Third Edition, Jonathan Pevsner, Wiley-Blackwell, 2015.
Otras referencias bibliográficas, electrónicas o cualquier otro tipo de recurso.
Aparecerán en la sección correspondiente de la asignatura en la plataforma de docencia online de la Universidad de Salamanca
9. Evaluación
Criterios de evaluación.
8.1: Criterios de evaluación:
CONVOCATORIA ORDINARIA:
Nota parte teórica (T): 70% examen final
Nota parte práctica (P): 30% cuaderno de prácticas
La nota final de la asignatura será: T*0.7+P*0.3
No es necesario tener una calificación mínima en ninguna de las dos partes.
CONVOCATORIA EXTRAORDINARIA:
Nota parte teórica (T): 70% examen final
Nota parte práctica (P): 30% cuaderno de prácticas
La nota final de la asignatura será: T*0.7+P*0.3
No es necesario tener una calificación mínima en ninguna de las dos partes.
Dado que el cuaderno de prácticas se entrega el último día de docencia presencial del curso y, por tanto, en fechas muy próximas a las pruebas de ambas convocatorias, la nota de la parte práctica en la convocatoria extraordinaria será la misma que la obtenida en la convocatoria ordinaria.
Sistemas de evaluación.
8.2: Sistemas de evaluación:
Teórico: Examen final tipo test (40 preguntas, 4 respuestas posibles, penalización por respuesta errónea 0.33 puntos). Dada la interconexión total entre los contenidos teóricos y prácticos, las preguntas del examen incluirán cuestiones de ambas partes.
Práctico: Calificación obtenida en el cuaderno de prácticas en el que se presentará la resolución de tres ejercicios prácticos que se irán proponiendo a lo largo del curso. La entrega del cuaderno se hará el último día de docencia presencial del curso.
Recomendaciones para la evaluación.
8.3: Consideraciones generales y recomendaciones para la evaluación y la recuperación:
Asistir regularmente a las clases teóricas. Estudio autónomo. Utilización de las tutorías para la resolución de las dudas que se planteen.