Microbiología

En esta asignatura se pretende dar a conocer los aspectos más importantes de la diversidad microbiana y de la evolución. Incluye el estudio de su distribución en la naturaleza, las relaciones entre ellos y con el resto de los seres vivos, sus efectos beneficiosos y perjudiciales sobre los seres humanos y los cambios físicos y químicos que realizan en el ambiente. Se resalta su importancia en los diferentes aspectos alimentarios, sanitarios, industriales y medioambientales.

Las materias impartidas en esta asignatura tienen interés en las siguientes orientaciones profesionales: Biólogo/a (BIR, análisis clínicos, ambientales y alimentarios, Biotecnología), Investigación, Docencia.

La asignatura se divide en los siguientes bloques temáticos y temas:

Bloque I. Virología

Se dará una visión somera de la diversidad, ciclos biológicos y capacidad patogénica de virus representativos de los diferentes grupos de Baltimore.

Tema 1. Generalidades. Nomenclatura y Clasificación de los virus

Tema 2. Virus con ARNmc (+)

Tema 3. Virus con ARNmc (-) y ARNbc (+/-)

Tema 4. Virus con ARNmc o ADNbc y Transcripción inversa.

Tema 5. Virus con ADNbc (+/-). Viroides y priones. Origen y Evolución de los virus.

Bloque II. Diversidad Genética Microbiana

Tema 6. Variabilidad Genética Microbiana I. Concepto general. Transformación. Transducción

Tema 7. Variabilidad Genética Microbiana II. Conjugación. Plásmidos: relevancia fisiológica.

Tema 8. Genómica microbiana

Bloque III. Diversidad Microbiana

Tema 9. Taxonomía microbiana y evolución. Principios generales. Criterios de clasificación: pruebas bioquímicas, genéticas y moleculares. Organización taxonómica.

Tema 10. Clasificación de los microorganismos. Historia. El manual de Bergey. Filogenia microbiana. Colecciones de referencia.

Tema 11. Arqueas

Tema 12. Espiroquetas y Espirilos

Tema 13. Bacterias aeróbicas Gram-

Tema 14. Bacterias anaeróbicas facultativas Gram-

Tema 15. Bacterias anaeróbicas Gram-

Tema 16. Rickettsias. Clamidias

Tema 17. Micoplasmas

Tema 18. Bacterias Quimiolitotróficas

Tema 19. Bacterias Fototróficas

Tema 20. Bacterias Gram+ I: bajo G/C

Tema 21. Bacterias Gram+ II: alto G/C

Tema 22. Bacterias con patrón de división polarizado. Bacterias con vaina. bacterias deslizantes.

Tema 23. Microorganismos eucariotas

Bloque IV. Microbiología Ambiental y Aplicada

Tema 24. Ecología microbiana. Ciclos Biogeoquímicos de los elementos.

Programa Clases Prácticas

Análisis microbiológico de aguas

Técnicas de identificación de microorganismos

Infección con bacteriófagos

Programa de actividades de Seminario (orientativo)

Act01- Recursos USAL: Bibliografía

Act02- Columna Winogradsky-I (Introducción y montaje)

Act03- Construcción Cápsidas Víricas Chimera

Act04- ORF Finder

Act05- Transgénesis (condicionada a disponibilidad laboratorio)

Act06- Patogénesis microbiana

Act07- CRISPR-Cas

Act08- Resistencias a antibióticos

Act09- Microbioma Intestinal Humano

Act10- Cianobacterias

Act11- Restauración de Microbiotas I

Act12- Restauración de Microbiotas II

Act13- Columna Winogradsky-II (Análisis de resultados).

Este listado de actividades de seminario es orientativo y puede modificarse. Las actividades 01, 02, 03, 04, 11 y 13 serán desarrolladas por los estudiantes siguiendo las instrucciones del profesor. La actividad 05 se lleva a cabo en laboratorio. El resto de actividades consisten en la exposición por el profesor y debate con los estudiantes de temas de gran actualidad relacionados con la Microbiología. A solicitud de los estudiantes se podría sustituir alguna de estas actividades por otras que se considerasen de interés general.

Dominar el conocimiento de los diferentes niveles de organización de la materia viva, su origen y los mecanismos evolutivos.

El alumno conocerá:

  1. Concepto y origen de la vida

  2. Tipos y niveles de organización de la vida

  3. Bases genéticas de la biodiversidad

  4. Diversidad de microorganismos

  5. Sistemática y filogenia

  6. Estructura, función e interacción entre biomoléculas

  7. Replicación, transcripción, traducción y modificación del material genético

  8. Metabolismo

  9. Estructura y función de los virus, células procarióticas y eucarióticas

10. Regulación de la actividad microbiana

11. Interacciones entre especies

12. Flujos de energía y ciclos biogeoquímicos en los ecosistemas

Permitir al egresado el ejercicio de actividades de estudio, identificación, análisis y clasificación de los organismos vivos y de los agentes materiales biológicos, así como sus retos y señales de actividad.

- Madigan, M.T., Martinko, J.M., Bender, K.S., Buckley, D.H. y Sathl, D.A. (2015) Brock. Biología de los microorganismos. 14ª Ed. Pearson Education, S.A. (RECOMENDADO)

- Willey, J.M., Sherwood, L.M. y Woolverton, C.J. (2016) Microbiology de Prescott, Harley y Klein. 10 Ed. McGraw-Hill-College.

- Tortora, G.J., Funke, B.R. y Case, C.L. (2015) Microbiology. An introduction. 12th Ed. The Benjamin/Cummings Publishing Company. Addison Wesley Longman, Inc. San Francisco

- Durante el transcurso de la asignatura se emplearán los diversos recursos didácticos, de interacción y de comunicación asociados a las cuentas de email USALgoogle proporcionadas oficialmente por la Universidad de Salamanca: almacenamiento y ofimática (USALdrive) / blogs (Diarium) / Recursos diversos (Biblioteca de Biología/Biblioteca USAL) / mensajería instantánea (Hangouts Chat y Meet)

- El acceso a los recursos de todo tipo se canalizará a través del espacio en Studium 108220 Diversidad Microbiana 2020-2021 y el Symbaloo Recursos DM específicos para la asignatura.

La comprobación de la adquisición de competencias y el cumplimiento de objetivos se valorará teniendo en cuenta el sumatorio del conjunto de factores que se detallan:

1. Prueba escrita objetiva
2. Evaluación continua sobre el desarrollo de las prácticas
3. Actividades tutorizadas en aulas de informática o realizadas por el alumno en casa sobre recursos microbiológicos “on line”
4. Participación en clase y asistencia

1. Adquisición de conocimientos teóricos sobre la diversidad microbiana
2. Adquisición de conocimientos y habilidades prácticas sobre un proceso modelo
3. Adquisición de conocimientos sobre recursos Web y bases de datos de utilidad en Microbiología y Virología
4. Valoración de su asistencia y participación a lo largo del curso

Evaluación continua de las actividades:

• Consultas bibliográficas
• Ejercicios y trabajos prácticos de seminarios y actividades en aulas informáticas
• Prácticas de laboratorio
• Tutorías

Prueba escrita sobre el dominio de las competencias que consistirá en un test de respuesta única y preguntas cortas de razonamiento sobre los contenidos teóricos y prácticos desarrollados durante el curso.

La evaluación continua contribuirá en un 40% (30% actividades + 10% Prácticas) a la calificación final y la prueba escrita sobre Teoría en un 60%. Será necesario alcanzar la puntuación mínima (50%) requerida en cada una de las partes para poder superar la asignatura. 

Es muy aconsejable el repaso semanal tanto de los temas teóricos como de las diferentes actividades planteadas y la consulta temprana a los profesores de todas las dudas que surjan.

El alumnado podrá comprobar periódicamente el nivel de comprensión de los bloques temáticos mediante ejercicios de autoevaluación y la realización de alguna prueba parcial voluntaria, que podrá ser eliminatoria si se demuestra la adquisición de las competencias propuestas.

Solo se conservarán las notas de prácticas y una evaluación continua positiva, debiéndose repetir la prueba objetiva correspondiente a los contenidos teóricos hasta superar la asignatura.